從目前行業內普遍使用情況看，主要有兩種電機：高效稀土永磁有刷電機與高效稀土永磁目前市場上大多數電動自行車還停留在有刷電機階段。有刷電機采用機械換向，對控制系統的技術要求較低，相對成本低于無刷電機，有刷電機的起動力矩略大于無刷電機。但致命的弱點是：壽命短、噪聲大、效率低。它長期使用碳刷磨損嚴重，較易損壞。同時磨損產生了大量的碳粉塵，這些粉塵落下齒輪油中，使齒輪油加速干涸，電機噪聲進一步增大。有刷電機使用到一年左右就需要更換內碳刷，你會發現充電一次行駛的里程不及新車買來時的三分之二，而且爬坡時動力不足，還會燒壞控制器。這是因為電機更換碳刷后，換向器也被磨出了一條凹槽，使碳刷接觸面積減少，接觸不良的碳刷通電后會產生火花并加快氧化換向器和銅片，導致上述不良現象。  

有刷高速電機（3600轉/分鐘左右）目前被國內大多數電動自行車生產廠家所選用，它采用碳刷作為電機電源的兩個觸點，利用調速轉把和控制器來控制，通過齒輪二次減速及超越離合器來達到電動自行車0-20公里/小時的無極調速。裝有無刷電機的電動自行車行駛速度必須到35公里/小時以上時，才能發揮其工作效率，但是我們知道電動自行車作為非機動車來管理，時速必須在20公里/小時以下，故無刷電機被電動自行車選用降低了工作效率，可取性不強。 

無刷電機以電子換向取代機械換向，技術上要優于有刷電機。由于無刷電機沒有齒輪或減速裝置，減少了電機磨損的不可靠性。它的效率在一定電流范圍內比有刷電機效率高。無刷電機行駛起來幾乎沒有噪聲，且壽命長達10年以上。據于兩者比較，無刷電機要優于有刷電機。目前，已有一些電動自行車生產廠原先用有刷電機現改用了無刷電機。無刷電機肯定是今后電動自行車的發展方向。
  消費者可從外觀上來識別電機屬于“有刷”還是“無刷”：首先，“無刷”電動車引線有8根，而“有刷”電動車引線為正負極有兩根；其次、用手帶動電機時，“無刷”電機前后轉動都輕松，而“有刷”電機前轉輕松，后轉時比較緊來區別。